Mit dem Ballastwasser werden Organismen in Gebiete gebracht, in die sie nicht gehören. Die ökologischen und wirtschaftlichen Schäden, die durch invasive Meerestiere verursacht werden, sind enorm.
Es wurden vielversprechende Ansätze für die Entnahme und Analyse von Ballastwasserproben entwickelt, die jedoch noch weiter in der Praxis untersucht werden müssen, um ihren Nutzen für die Überwachung der Einhaltung der Vorschriften zu prüfen.